In der Kirchenzentrale befinden sich das Sekretariat und die Finanzverwaltung. Die Kirchenzentrale ist für Repräsentation und Finanzen der Kirche zuständig.
Die Betriebskosten der Kirche werden teilweise aus staatlichen Mitteln finanziert und teilweise durch Spenden und Zuschüsse gedeckt. Da die Mittel aus dem Staatshaushalt reduziert werden, wächst die Bedeutung der Gaben von den Mitgliedern der einzelnen Gemeinden.
Der Bischof ist für die gesamte Tätigkeit der Kirche verantwortlich. Für die Ausübung seiner Funktion ist er der Synode verantwortlich.
Der Bischof wird bei der Synode aus den Geistlichen im aktiven Dienst gewählt, die seit mindestens 15 Jahren in der Kirche dienen. Die Amtsperiode dauert 6 Jahre und der Bischof kann höchstens zweimal gewählt werden. Sein Amt kann er bis zum 65. Lebensjahr ausüben.
Zur Zeit übt Mag. Jan Wacławek die Funktion des Bischofs aus.
Die Synode ist das höchste Kirchenorgan und entscheidet über alle kirchlichen Angelegenheiten ausser denen, die die internen kirchlichen Vorschriften anderen Kirchenorganen zuordnen.
Der Kirchenrat hat seinen Sitz in Český Těšín, in der Kirchenzentrale.
„Ale ti, kdo skládají naději v Hospodina, nabývají nové síly; vznášejí se jak orlové, běží bez únavy, jdou bez...
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